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FORMATION

Bioindication par les thécamibes

09/10/25 07:00

Informations générales

La sécheresse est le principal danger qui menace les tourbières en Suisse ; la remise en eau par la fermeture des drains est donc l’une des mesures essentielles de conservation de ces milieux. Pour évaluer le succès de ces mesures de renaturation, une possibilité est de s’intéresser à des bioindicateurs, des organismes dont la présence renseigne sur certains facteurs écologiques d’un environnement. Historiquement, ce sont surtout des espèces végétales ou animales qui sont utilisées comme bioindicateurs, mais un autre groupe d’organismes a récemment été utilisé à ces fins : les amibes à thèque (à coquille), ou thécamibes, un groupe de micro-organismes abondant en tourbière et très sensible aux variations hydrologiques. De plus, comme la coquille de ces amibes est résistante et préservée dans la tourbe souterraine. L’observation des thécamibes permet ainsi de retracer l’évolution hydrologique d’une tourbière sur des centaines, voire des milliers d’années. Lors de cette journée de formation, nous collecterons des carottes de tourbe pour en extraire les amibes à thèque. Nous identifierons et compterons ces organismes au microscope, pour produire une estimation de la profondeur de la nappe d’eau des sites échantillonnés via des outils statistiques.

Objectifs d'apprentissages

La formation est destinée aux professionnels ayant des bases en biologie et travaillant dans les domaines de la protection, de la renaturation et du suivi des tourbières.

Au travers de cours théoriques et d’exercices pratiques, le but de ce cours est d’introduire les participants au concept de bioindication, à la collecte de carottes de tourbe, à l’observation d’amibes à thèque au microscope et à l’utilisation d’outils statistiques pour évaluer la profondeur de nappe d’eau d’une tourbière.

Lieu

Maison de la Tourbière - Hôtel-restaurant du Cerf, Rue Major-Benoît 3, Les Ponts-de-Martel, Suisse

Durée

8 heures

Langue

Français. Une traduction simultanée pourra être proposée pour les personnes germanophones et anglophones.

Tarif et inscription

Tarif : CHF 120.–

Délai d’inscription : 1 semaine avant

À prendre avec

- Habits adaptés à la saison
- Pique-nique du midi
- De quoi noter, photographier

Déroulement

Arrivée ; croissants et cafés


Introduction générale :

  • rappels généraux sur l’écologie des tourbières (notions de hauteur de nappe, pH , gaz, …),

  • services écosystémiques des tourbières (tampons hydriques, puits de carbone, …),

  • état des lieux concernant les tourbières à l’échelle mondiale et locale (changement climatique, drainage et exploitation),

  • renaturation des tourbières : méthodes existantes et cas pratiques.


Principes généraux de la bioindication :

  • utilisation des amibes à thèques comme estimateurs de l’efficacité de la renaturation des tourbières,

  • utilité des proxys et réduction des coûts comparé à une campagne classique,

  • végétation et typologie des milieux,

  • importance des sphaignes,

  • arthropodes : travaux sur les libellules dans les tourbières du Jura,

  • palynologie : utilité paléoécologique des pollens en tourbière/sédiments de lacs/zones humides,

  • amibes à thèques : généralités, bases de phylogénie. Présentation des grands groupes, et de quelques espèces-types importantes et faciles à déterminer.


Partie pratique :

  • échantillonnage et extraction des amibes à thèques

  • observation et comptage des amibes à thèque au microscope

  • méthodes de traitement de données :

    • weighted-averages : méthode la plus simple d’utiliser les préférences des amibes pour calculer une profondeur de nappe.

    • modeling de base : principes des modèles simples de machine learning et lien avec les fonctions de transfert,

    • Fonction de transfert : présentation du fonctionnement précis et du jeu de données d’entraînement, explication des écueils à éviter : data management, erreurs d’identification, groupement des amibes.

  • Essai sur un jeu de donnée prévu à cet effet (données Forbonnet ou autre site du Jura).

Intervenants

Robin Calisti
Robin Calisti

Paléoécologue, utilisant et développant des bioindicateurs se basant sur les amibes à thèques en tourbière

Inscription à la formation

Veuillez remplir le formulaire pour faire une demande d'inscription à la formation.

Informations personnelles du participant

Informations sur la formation

Langue de préférence Obligatoire

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31/05/25 07:30

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28/06/25 08:00

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12/07/25 08:00

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13/07/25 11:00

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Au fil d’une balade l’après-midi, partez à la découverte des libellules qui peuplent tourbières et milieux humides ! Ces insectes anciens aux allures de bijoux volants jouent un rôle clé dans les écosystèmes aquatiques. Leur cycle de vie, entièrement dépendant de l’eau, en fait des indicateurs précieux de la qualité de l’environnement. Ce cours allie observations sur le terrain et apports théoriques : vous apprendrez à reconnaître les odonates, comprendre leur écologie, et découvrir leur rôle au sein de ces habitats sensibles.

Mycologie et tourbières

27/07/25 08:00

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Peu connus du grand public, les champignons phytopathogènes jouent pourtant un rôle subtil mais fondamental dans les écosystèmes des tourbières. En interagissant avec les plantes – parfois en les affaiblissant, parfois en cohabitant avec elles – ces micro-organismes influencent profondément les équilibres végétaux et les dynamiques de ces milieux sensibles. Cette sortie propose une immersion dans cet univers discret et fascinant, au cœur des marais.

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23/08/25 08:00

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Bioindication par les thécamibes

09/10/25 07:00

Bioindication par les thécamibes

L’évaluation de la réussite des travaux de renaturation en tourbière nécessite des indicateurs fiables. Cette formation propose une introduction approfondie à l’utilisation des amibes à thèque comme bioindicateurs hydrologiques. Sensibles aux variations de l’humidité et bien conservées dans la tourbe, ces micro-organismes permettent d’estimer la profondeur de nappe phréatique actuelle et passée. La journée combine apports théoriques, terrain, travail en laboratoire et initiation aux outils statistiques utilisés dans l’interprétation des données.

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Mycologie et tourbières

Au cœur des marais et tourbières, les champignons forment un monde discret mais essentiel. Visibles au détour d’un sentier, ces organismes fascinants jouent un rôle écologique clé dans la décomposition de la matière organique, les interactions avec les plantes, et les équilibres propres à ces milieux humides. Ce cours vous propose d’explorer cette diversité singulière, entre apports théoriques en salle et observations naturalistes sur le terrain.

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Horaires du centre d'interprétation


Jusqu'au 22 septembre


Lundi et mardi : Fermé

Mercredi à vendredi : 14h – 17h

Samedi et dimanche : 10h – 17h 


Sur demande, possibilité de bénéficier d'une visite guidée hors des heures d’ouverture pour les groupes et les écoles.


Du 25 septembre au 17 juin 2025


Lundi et mardi : Fermé

Mercredi à dimanche : 14h – 17h


Sur demande, possibilité de bénéficier d'une visite guidée hors des heures d’ouverture pour les groupes et les écoles.


Horaires du restaurant

Du mercredi au samedi

8h00 - 23h30


Le dimanche

8h00 - 15h00


L'hôtel est ouvert 7j/7

Petit-déjeuner de 8h00 à 10h00 sauf pour les nuitées du dimanche soir et du lundi soir.

Rue Major-Benoît 3

2316 Les Ponts-de-Martel

Local à vélos – Local à skis 

Wifi dans tout le bâtiment

Parkings à proximité avec bornes électriques

Accès pour personnes à mobilité réduite

CONTACT ET RÉSERVATIONS

I CENTRE D'INTERPRÉTATION

032 937 27 77 (réponse uniquement l'après-midi)

accueil@mdt-ne.ch


I HÔTEL-RESTAURANT-SALLE POLYVALENTE  

032 937 13 33

cerf@mdt-ne.ch

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